Дебют актрисы в кино состоялся в начале 1990-х, она сыграла в фильмах «Изыди!» (1991), «Русская невеста» (1993). В 1995 Ксению пригласили принять участие в съёмках двух немецких фильмов «Николай II» и «Прокофьев». В 1997 актриса снималась в американской картине «Анна Каренина». С 1998 г. ей начали предлагать и роли в отечественном кино. В 1998 г. Ксения Раппорт снялась в фильме «Цветы календулы», а через год - в картине по пьесе Надежды Птушкиной «Плачу вперёд!». Начиная с 2000 г., актриса стала активно сниматься в сериалах. Сначала Раппопорт сыграла в популярном «Бандитском Петербурге», затем приняла участие в съёмках таких телепроектов, как «Убойная сила», «По имени Барон», «Гибель империи», «Ликвидация», «Есенин». Из последних фильмов с участием актрисы можно выделить следующие: «Невестка», «Всадник по имени Смерть», «Незнакомка». Последний, кстати, был снят итальянским режиссёром Джузеппе Торнаторе. Ксения сыграла здесь украинскую проститутку Ирину, приехавшую в поисках работы в Италию, и попавшую в сексуальное рабство. За этот фильм россиянка получила престижный приз Давида Ди Донателло как лучшая актриса. В 2009 г. Ксения Раппопорт представляла итальянскую картину «Двойной час» на Венецианском кинофестивале. Её роль Соньи в этом фильме была отмечена как лучшая.
В конце 2009 г. актрисе присвоили звание Заслуженной артистки РФ.
