В 1991 году переехала жить в Израиль. Дважды (в 2000 и 2002 годах) была признана Театральной актрисой года в Израиле. В 2003 году снялась в фильме «Было или не было» о любовной истории израильской актрисы театра «Габима» Ханы Ровины и поэта Александра Пэнна, за роль в котором актриса получила приз за лучшую женскую роль на фестивале еврейского кино в Варшаве.
В 2009 году на 61-й церемонии празднования независимости Израиля актриса была удостоена чести зажечь факел за особый вклад в развитие еврейского театра. В 2010 году Тель-Авивский университет присвоил ей звание почетного доктора за выдающийся вклад в развитие израильского искусства.
В 2011 году вышел фильм «По тебе не видно», который стал лауреатом Берлинского кинофестиваля, а также Хайфского международного кинофестиваля в категории Лучший фильм, а исполнившая в нём главную голь Евгения Додина получила приз за лучшую женскую роль.
В 2016 году вышел фильм «Неделя и один день» режиссера Асафа Полонски, где Додина сыграла главную роль. Картина стала лауреатом израильской премии Офир и была представлена в конкурсной программе международного Каннского кинофестиваля, фильм выиграл на киносмотре приз GAN Foundation Award.
В мае 2020 года вышел эпизод сериала «Убивая Еву», где Додина исполнила роль матери главной героини.
