После событий пятого фильма, Гил отправляет Фина в меловой период, чтобы уничтожить первое акулье торнадо и спасти мир от будущей катастрофы. Там он выясняет, что Эйприл, Нова и Брайан живы. Сын также выдернул их разных временных периодов для помощи отцу.
Команда справляется с задачей, после чего совершает прыжок во времени. Так они оказываются во средневековом Камелоте, где знакомятся с недружелюбной колдуньей Морганой и Мерлином. Как оказалось, Гил также был здесь и оставил чертежи по созданию моста Эйнштейна-Розена.
Приближается очередное шаркнадо. Вооружившись Экскалибуром, Фин останавливает стихию, после чего их ждет очередное перемещение. В этот раз в период войны за независимость США. Теперь им надо остановить шторм, иначе история Америки будет переписана.
С огромным трудом главные герои убеждают Джорджа Вашингтона и Бенджамина Франклина предоставить им пушки для уничтожения Шаркнадо. Они в очередной раз побеждают, однако Брайан изъявляет желание остаться.
Следующей остановкой становится Дикий Запад. Шериф арестовывает Фина, ведь принял его за сообщника Билли Кида. В соседней камере оказался Гил, однако воссоединиться с сыном не получается, ведь его ведут на казнь.
Остальные неожиданно встречают Скай. Она помогает Фину и Гилу сбежать, после чего начинается очередное шаркнадо, в ходе которого шериф погибает. Главный герой выигрывает дуэль у Билли Кида и команда угоняет поезд для нового прыжка.
Команда попадает в 1950-е года. Там Гил подключил молодых родителей Фина к борьбе с акульим торнадо. Одержав победу, они перемещаются в Сан-Франциско образца 1997 года, где Нова рассчитывает спасти своего дедушку от смерти.
Фин хоть и пытался отговорить подругу от этой затеи, но все же соглашается помочь. Нова добивается своей цели, но акулы пожирают ее вместе с Эйприл, а голова киборга падает в океан.
Фин и Скай прыгают в будущее, но совершают ошибку и оказываются в 20013 году, где власть над миром захватила Эйприл-киборг. При этом она оживила настоящую Эйприл, чтобы использовать ее ДНК для создания армии клонов.
Киборг отправляет Скай в стазис и теперь пытается забрать ДНК Фина, ведь ей нужен король. Начинается борьба, в ходе которого Эйприл пробуждается и помогает мужу отправиться в 2013 год, когда происходили события первого фильма.
Фин оказывается на лодке капитана Сантьяго, чья команда и нашла голову Эйприл. Киборг из будущего пытается вернуть мужа, только он предпочел с помощью головы жены восстановить временную линию и покончить с торнадо навсегда.
Так появляется новая временная линия. Человечеству больше ничего не угрожает. Все семейство Шепардов и их друзья живы. Они вместе управляют баром, а впереди ждет только долгая и счастливая жизнь.
