Флэшбэк. Андроид беседует со своим создателем, главой «Корпорации Вейланд» Питером Вейландом. Андроид чувствует себя живым, он умеет самостоятельно мыслить и выбирает себе имя Дэвид (в честь скульптурного шедевра Микеланджело). Разговор заходит о том, что люди, сотворив андроидов, совершили то, по сравнению с чем меркнут все предыдущие достижения человечества в науке и искусстве. Андроиды должны служить человеку. Но кто создал человека – вопрос вечный. Раскрыть эту тайну человечеству так и не удалось.
Колонизаторский космический корабль «Завет». 2104 год. Экспедиция направляется на планету Оригае-6. На борту «Завета» две тысячи колонистов, пятнадцать членов экипажа и тысяча эмбрионов. Люди пребывают в состоянии гербинации. Кораблем управляет андроид Уолтер с помощью бортового компьютера по имени Мама. «Завет» попадает в нейтринную вспышку, Уолтер вынужден в аварийном режиме вывести экипаж из криосна. На корабле вспыхивают очаги возгорания, несколько колонистов и капитан корабля Джейкоб Брэнсон погибают. Жена Джейкоба Дэниелс тяжело переживает гибель супруга. Командование кораблем берет на себя Кристофер Орам. Провожая Джейкоба в последний путь (его тело выпущено в открытый космос), Дэни говорит коллегам, что они с мужем мечтали построить дом на берегу озера, начать жизнь в новом мире. Теперь ей не с кем осуществить эту мечту. Во время работ по устранению повреждений «Завета» экипаж корабля получает загадочный сигнал с неизвестной планеты. Бортовой компьютер сообщает, что эта планета пригодна для жизни, условия здесь даже лучше, чем в изначальном пункте назначения «Завета», и находится она гораздо ближе. Дэниэлс категорически против изменения курса, однако Орам принимает решение отправиться на вновь обнаруженную планету.
Часть экипажа высаживается на планете с целью осмотреть ее. Здесь обнаружены посевы пшеницы и другая растительность. Дэни кажется подозрительной абсолютная тишина: ни птиц, ни животных вокруг нет. Отряд разделяется. Карин (супруга Криса Орама) остается собирать образцы для исследования, ей помогает еще один член экипажа. Остальные отправляются искать источник сигнала, который находится примерно в восьми километрах к западу на значительном возвышении. Вскоре они обнаруживают потерпевший десять лет назад крушение корабль «Прометей», находят жетон с именем Элизабет Шоу. В дыхательные пути одного из членов команды случайно попадают инопланетные споры. Он заражен. Аналогичная ситуация происходит с мужчиной, который остался с Карин. Их отправляют на карантин. Из тела инфицированного космонавта вылезает жуткое существо небольших размеров, он уничтожает Карин. Фэрис открывает огонь, пытаясь уничтожить пришельца, но ее стрельба приводит к взрыву. Все находящиеся на его борту челнока погибают.
Наступает ночь. Космонавты подвергаются атаке агрессивных инопланетных существ. Появляется Дэвид, он отгоняет Чужих и приводит людей в город Создателей. Люди устраиваются на ночлег. Андроиды в это время общаются. Дэвид обучает Уолтера искусству игры на свирели. Они пытаются выявить отличия между собой. Оказывается, Уолтер – более поздняя модель – не способен к творчеству. Дэвид утверждает, что доктор Шоу относилась к нему лучше всех прочих людей. Она погибла при посадке. Двое членов экипажа пытаются установить связь с «Заветом», которая затруднена из-за грозы. На одну из представителей экспедиции нападает монстр и убивает ее. Орам убивает тварь выстрелом из ружья. Он требует от Дэвида объяснений. Тот рассказывает капитану, что сумел вывести идеальное существо, способное паразитировать в теле любого животного. Он показывает Ораму кладку яиц этого существа. Из одного яйца выскакивает личинка Чужого и вцепляется Ораму в лицо. Через некоторое время Дэвид наблюдает за процессом рождения из тела человека нового Чужого.
Оставшийся за главного на «Завете» Теннесси переводит корабль на более низкую орбиту, несмотря на то, что бортовой компьютер предупреждает его о чрезвычайной опасности подобных маневров. Затем он пересаживается на грузовую платформу и летит на помощь товарищам. Оставшиеся в живых члены наземной группы находят тело капитана и выясняют, что именно Дэвид распылил над планетой патогенный вирус, уничтожив местную цивилизацию Создателей и все формы животной жизни. Это позволило ему беспрепятственно проводить свои опыты. Лоуп и еще один член экипажа в поисках Орама спускаются в подвал. Лоупа атакует паразит, вцепляется ему в лицо, но товарищи освобождают его. Лицо Лоупа сильно повреждено. Выросшее в теле Орама существо атакует, оно убивает напарника Лоупа, ему самому удается спастись.
Дэниэлс в лаборатории рассматривает картинки, нарисованные Дэвидом. Это иллюстрации жизненного цикла чудовища от яйца до взрослой особи. На одном изображении она видит тело Элизабет Шоу с разорванной грудной клеткой. Дэни понимает, что обезумевший андроид убил Шоу и использовал ее тело для выращивания паразита. Дэвид нападает на Дэниэлс, но с ним вступает в схватку Уолтер. Земляне успевают забраться на борт грузовой платформы. В последний момент это удается сделать и Уолтеру. На дне платформы обнаружено чудище. Дэни выбирается наружу и вступает с ним в схватку. При помощи товарищей, находящихся внутри, ей удается одержать победу. Чужой раздавлен механической клешней для поднятия грузов. Люди и андроид оказываются на борту звездолета. Пострадавшего от нападения паразита Лоупа помещают в медицинский отсек. Ночью Дэни будит сигнал тревоги. Больной убит вырвавшимся из его тела Чужим. Вооружившись, Теннесси и Дэниэлс преследуют монстра, который успевает убить в душевом отсеке еще двух членов экипажа. При помощи андроида последним оставшимся в живых членам экипажа удается выкинуть монстра в открытый космос.
Звездолет отправляется в прерванное путешествие. Дэниэлс укладывается в гибернационную капсулу. Ей помогает андроид. Уже приготовившись ко сну, Дэниэлс интересуется у андроида: поможет ли он ей построить на новой родине дом у озера, о котором они мечтали с покойным мужем. В последний момент женщина понимает, что ее вопрос андроиду не понятен. Она в ужасе колотится к криокамере: под видом Уолтера на корабль пробрался Дэвид. Андроид остается единственным бодрствующим существом на борту корабля. Он берет под контроль бортовой компьютер, отправляется в отсек, где хранятся эмбрионы следующего поколения колонистов. Дэвид отрыгивает припрятанные им в собственном теле эмбрионы монстров и помещает их рядом с эмбрионами людей. Корабль продолжает свой полет.
