Создатели мультфильма описали Джимми Нейтрона, как состоящего на «одну треть из Барта Симпсона, одну треть из Альберта Эйнштейна и ещё одну – из Джима Керри».Изначально проект задумывался как телевизионный пилотный выпуск для мультсериала «Приключения Джимми Нейтрона, мальчика-гения»(2002). Тем не менее, когда боссы студии Paramount ознакомились с ранними наработками и кадрами, они были настолько впечатлены увиденным, что приняли решение профинансировать выпуск мультфильма в кинотеатрах.Страшная история, которую Ник рассказывает у костра, отсылает к популярному малобюджетному хоррору «Ведьма из Блэр: Курсовая с того света»(1999).Происхождение имени Шина Эстевеса связано с настоящим именем актёра Мартина Шина – Рамон Эстевес. Похожий псевдоним взял себе и его сын, Чарли Шин, настоящее имя которого – Карлос Эстевес.Для того чтобы продвинуть фильм и обеспечить ему внимание общественности, создатели выпустили несколько короткометражных мультфильмов о повседневной жизни Джимми Нейтрона и за несколько месяцев до выхода полнометражной картины транслировали их по Nickelodeon. Привычка пса-робота Годдарда притворяться мёртвым была перенесена в фильм как раз из такой короткометражной работы. По её сюжету, Джимми и Синди соревновались в том, чей питомец лучше.Это первый фильм Nickelodeon, полностью созданный в компьютерной графике. Для его создания не использовалось особое профессиональное программное обеспечение, разработанное специально для фильма. Все инструменты, с помощью которых создатели претворили свой замысел в жизнь, распространялись на массовых площадках и были доступны любому желающему за определённую цену.Изначально голосом короля Губота V был Кевин Майкл Ричардсон, но впоследствии в ходе работы над фильмом реплики персонажа были перезаписаны Патриком Стюартом, чей голос можно услышать в финальной версии. Тем не менее, в трейлере фильма всё же можно услышать наработки Ричардсона.Согласно официальному сайту о мультфильмах про Джимми Нейтрона, город Ретровилль, где проживают герои, находится где-то в Техасе (возможно, в пригороде Хьюстона или Далласа). Об этом также свидетельствует момент в фильме, когда у модифицированного Годдарда можно увидеть техасский номерной знак с надписью «плохая собака», датированный октябрём 2002 года.Незадолго до того, как дети отправляются в космос, Годдард делает звучное объявление. Голос, которым он произносит свои реплики – это голос суперкомпьютера W.O.R.P. (или Джошуа) из фильма «Военные игры»(1983).Идея особой газировки «Burping Soda», которую изобретает Джимми Нейтрон, была предложена режиссёру Джону А. Дэвису его дочерью Зои.Когда все дети празднуют исчезновение своих родителей, на заднем плане играет песня группы Ramones «Blitzkrieg Bop». Строчка «shoot `em in the back now» («а сейчас выстрелите им в спину») была приглушена, судя по всему, чтобы не поднимать возрастной рейтинг семейного фильма.Когда герои достигают планеты Йолкус, Джимми Нейтрон произносит: «Я нашёл их, повторяю, я нашёл их». Эту фраза звучит в фильме «Звёздные войны. Эпизод 5: Империя наносит ответный удар»(1980), когда Хана Соло и Люка Скайуокера находят на планете Хот.В альбоме с оригинальным саундтреком из фильма находится песня «The Chicken Dance», исполненная группой Stupid, хотя в самой картине звучит версия этой композиции от Emeralds.Здесь, как и в первой части мультфильма «Шрек»(2001), принимал участие опытный актёр озвучивания Джим Каммингс. Обе картины также были номинированы на премию Оскар за лучший анимационный фильм, что является первым подобным случаем для Paramount и Nickelodeon Movies.Эта работа является третьим по счёту сотрудничеством актёров Дэвида Л. Лэндера и Дэнни Манна после мультфильмов «Том и Джерри: Большой побег»(1992) и «Приключения Флика»(1998).Этот фильм стал первым опытом озвучивания для актёра Джеффри Гарсии. Послужной список его последующих работ в этой сфере достаточно широк: Пип из фильма «Рога и Копыта»(2006), Ринальдо – «Делай ноги»(2006) и «Делай ноги 2»(2011), одна из собак на пляже – «Мармадьюк»(2010), Типа – «Рио»(2011) и птица колпица – «Рио 2»(2014).На создание персонажа Шина Эстевеса Джона А. Дэвиса вдохновила его собственная любовь к коллекционированию. Изначально герой должен был быть японского происхождения, но в ходе подбора актёров подходящего для озвучивания японца найти не удалось, поэтому Шин стал мексиканцем.Во время общения по видеосвязи с пришельцами, Джимми Нейтрон отдаёт «вулканский салют» - особое приветствие, жест, ставший известным благодаря сериалу «Звёздный путь»(1966). Патрик Стюарт, принявший участие в озвучивании мультфильма, исполнял роль в одном из проектов в этой вселенной: он сыграл капитана Жана-Люка Пикара в сериале «Звездный путь: Следующее поколение»(1987).Последний фильм Nickelodeon Movies, снятый в формате экрана 16:9 (в кинематографе традиционно указывается как 1.85:1), до выхода полнометражного мультфильма «Губка Боб – квадратные штаны»(2004).Оригинальный тизер-трейлер к фильму полностью собран из очень ранних наработок, большая часть из которых ни коим образом не попала в итоговую версию. Например, можно заметить отличия в дизайне Джимми Нейтрона и короля Губота V. Во многих сценах, которые присутствуют и в трейлере, и в мультфильме, был изменён ракурс или фон. Также в трейлере присутствуют фрагменты короткометражных фильмов, которые были созданы для продвижения картины.Во время сцены, в которой показывается астероид с детским лагерем на нём, на фоне звучит композиция «I can count on you». В этот момент можно услышать расширенную версию песни, с фрагментами, которые отсутствуют в оригинале.Этот фильм стал третьей по счёту совместной работой для опытных актёров озвучивания Дэнни Манна и Джима Каммингса после мультфильмов «Балто»(1995) и «Бэйб: Поросенок в городе»(1998).Джимми Нейтрон мог получить имя Джонатан Квазар – именно такая идея была у создателей на раннем этапе производства. Вдохновлена она была прозвищем, которое Джону А. Дэвису дали его коллеги по работе. Тем не менее, компания Nickelodeon вынудила авторов пересмотреть своё решение, так как не хотела, чтобы героя нового мультфильма путали с другими персонажами с похожими именами (Капитан Квазар из одноимённой видеоигры, Джонатан Квест из мультсериала с аналогичным названием). Впоследствии мальчик-гений получил своё окончательное имя, Джеймс Исаак Нейтрон, с отсылкой на сэра Исаака Ньютона. Эта мысль посетила Джона А. Дэвиса, когда он выгуливал свою собаку.Второй в 2001 году анимационный фильм, над которым работал Джон Сайган, после картины «Последняя фантазия»(2001).Кэролин Лоуренс и Роб Полсен вместе работали над озвучиванием мультфильма «Губка Боб в 3D»(2015), где Лоуренс вновь повторила роль Сэнди, а Полсен озвучил чайку.На стадии производства картина сменила трёх композиторов, каждый из которых, так или иначе, отказывался от дальнейшей работы. Покинули проект Грэм Ревелл, Теодор Шапиро и Кристоф Бек.Имя персонажа Поултра (Poultra) образовано от слова «poultry», которое обозначает домашнюю птицу. Это неудивительно, ведь этот странного вида пришелец имеет некоторое сходство с курицей.В одной из сцен фильма на заднем плане можно увидеть Санта Клауса.Звук шагов Годдарда, робота собаки, создавался с помощью манипуляций с открытыми консервными банками.Первая работа Пола Гринберга по озвучиванию, которая не является аниме.Из всех актеров фильма Деби Дерриберри, Роб Полсен, Ларейн Ньюман, Карлос Алазраки, Джим Каммингс, Дэнни Манн, Джесс Харнелл, Дэвид Каугилл, Ди Брэдли Бейкер, Патрик Зейтц, Эйлин Галиндо, Мона Маршалл, Пол Гринберг, Кайл Хеберт и Фрэнк Велкер не являются знаменитостями.Третья совместная работа по озвучиванию для Джима Каммингса и Дэвида Л. Ландера после «Кто подставил кролика Роджера»(1988) и «Титан: После гибели Земли»(2000).После того, как Джимми уменьшается и сбегает, на заднем плане можно услышать фрагмент из основной композиции «Джимми Нейтрон».Незадолго до выхода фильма на параде в честь Дня благодарения в 2001 году в Нью-Йорке Джимми Нейтрон появился в виде гигантского воздушного шара.В одной из сцен фильма теряющая терпение Синди произносит фразу «Давай зажжём эту свечу». То же самое сказал самый первый астронавт NASA Алан Шепард, который нервничал во время подготовки к первому пилотируемому полёту на Меркурий из-за того, что штаб постоянно откладывал обратный отсчёт. Его предложение наконец «зажечь эту свечу» должно было поторопить замешкавшихся коллег.Пробы на роль Джимми Нейтрона проходили Нэнси Картрайт, Памела Адлон и Элизабет Дэйли.Когда Джуди и Хью Нейтрон смотрят телевизор и переключают каналы, можно увидеть рекламу сериала про Ультралорда, вымышленного внутри вселенной Джимми Нейтрона супергероя, и промо-ролик также вымышленного напитка Purple Flurp. Но в сетке вещания телевидения Ретровилля есть отсылки и на явления реального мира: один из каналов, на который переключается Хью – TV Land. Он принадлежит ViacomCBS (компании, которая владеет Paramount) и Nickelodeon. 
