В 2154 году, поиски редкого полезного ископаемого – анобтаниума – приводят корпорацию RDA на планету Пандора, населенную гуманоидами из племени на"ви, живущими в гармонии с природой и почитающими Древо Жизни. Люди перемещаются здесь, используя дистанционно управляемые аватары – симбиоз генома человека и местных жителей.
Джейк по заданию корпорации вместе с руководителем научного проекта Грэйс отправляется на исследование планеты и сбор биоматериалов. Парень чудом спасается от преследования местного хищника и знакомится с представительницей на"ви – Нейтери. Семена священного дерева облепляют землянина, и девушка истолковывает это как знак свыше. Она приводит его в свой клан, где на"ви принимают Джейка в свое общество.
Главный герой знакомится с культурой аборигенов, постепенно проникаясь к ним симпатией, в то время как его коллеги ожидают от него результата: юноша должен убедить народ покинуть обжитое место под Древом Жизни, где планируется добыча анобтаниума.
Руководство корпорации принимает решение уничтожить на"ви и направляет к ним тяжелую технику и вертолет. Но против агрессии землян восстают живые существа планеты, и во главе этого сопротивления оказывается Джейк, который вернул себе расположение на"ви, укротив местного летающего хищника – торука. Ему будет суждено отвоевать для клана их земли и навсегда остаться в теле аватара вместе со своей любимой Нейтери.
