Летом старшеклассник Ходака Морисима сбегает из своего родного дома расположенного на удалённом острове и тайком ото всей родни переезжает в Токио. В поездке на пароме, из-за воздействия мистического ливня Ходака чуть не сносится сильным штормовым порывом в открытое море, но его вовремя спасает человек по имени Кэйсукэ Суга, который предоставляет Ходаке в пользование свою визитную карточку, на случай, если ему когда-нибудь понадобится какая-либо помощь. Через некоторое время, пусть и непродолжительное, но наполненное безуспешным поиском заработка и достойного ночлега, будучи в неизведанном для себя городе, Ходака связывается с Кэйсукэ и нанимается в качестве помощника в его небольшой издательской компании. На работе, помимо заправляющего всем Кэйсукэ, Ходака встречает Нацуми Суга, племянницу Кэйсукэ соответственно. На пару Кэйсукэ и Нацуми исследуют городские легенды, в том числе связанные с необычной погодой в Токио. Когда к дуэту присоединяется и Ходака, от экстрасенса охотники за городскими легендами узнают историю о девушке, которая может контролировать погоду. В промежутке между работой и свободным времяпрепровождением Ходака встречает Хину, молодую девушку, которую силком и манипуляцией хотят устроить в сомнительной репутации клуб. Ходака спасает Хину от потенциально неблаговидно ожидающей её участи, и вдвоём они бегут в близнаходящееся заброшенное здание. В заброшенном здании со святыней, за счёт своеобразной молитвы Хина демонстрирует свою способность делать небо чистым. Вдохновлённый легендой о погоде, позже Ходака навещает Хину, и предлагает начать совместный бизнес; по концепции заработка Хина должна использовать свои необычайно таинственные способности на благо людям, которые хотят ясной бездождливой погоды для каких-нибудь особых событий, будь то день рождения, корпоративы и даже обычный родительский отдых с детьми.
В момент бизнес ребят становится очень успешным, и они начинают привлекать в разы большее количество клиентов. Как-то вечером, Ходака прячется в ванной комнате Хины, последняя разговаривает с местной полицией. Полицейские допрашивают Хину о местоположении Ходаки. Кроме того они говорят ей, что Ходака беглец, находящийся в розыске (хотя этот факт девушка знает от самого Ходаки). Видя, что несовершеннолетняя Хина живёт с младшим братом Наги в большой квартире без присмотра взрослых (ребята сироты), один из полицейских сообщает, что на следующий день отправит за ними сотрудников из социальной службы. Как только полицейские уезжают, Ходака видится с Кэйсукэ в его автомобиле. Кэйсукэ увольняет Ходаку со своей работы и даёт ему выходное пособие. Кэйсукэ сожалеет, что не может помогать Ходаке, потому что он не хочет никаких последствий из-за полиции, которые могли бы помешать ему видеться с его маленькой дочерью. Отчаявшись Ходака решает сбежать с Хиной и Наги. После затруднительных поисков, они проводят ночь в отеле, где Хина демонстрирует Ходаке, что её тело, из-за молитв за ясную погоду, медленно превращается в воду. Хина добавляет, что рано или поздно она исчезнет и перестанет существовать. Хина, ради других людей, хочет вернуть в город полноценное лето. Также Хина просит Ходаку позаботиться о её брате. Город тем временем сильно топит ливнями. Ходака отказывается принимать произносимое Хиной, обещая помочь ей. На следующий день Хина пропадает без вести, да к тому же дожди прекратились. Ходака отправляется на поиски Хины, но не успев далеко уйти, полиция задерживает его вместе с Наги.
Ходаке удаётся сбежать из полицейского участка и получить поддержку со стороны Нацуми. Полиция преследует Ходаку. В момент Ходака достигает здания со святыней, где Хина впервые получила свои силы. Внутри здания Ходака встречает Кэйсукэ, который пытается помешать ему бежать дальше. Полиции удаётся проникнуть в здание и окружить Ходаку. Кэйсукэ переосмысливает ситуацию и помогает Ходаке сбежать от полицейских. Объявляется и Наги, при помощи своих подружек сбежавший из детского центра опеки. Наги помогает Кэйсукэ сдержать полицейских. В итоге Ходаке удаётся достичь вершины здания и совершить переход через врата. Затем Ходака переносится в мир неба и вызволяет Хину. Когда Ходака и Хина обратно переносятся на землю, сквозь слёзы Ходака убеждает Хину начать жить для себя. Дожди возобновляются, и кажется, что видимого конца им нет. Проходит три года. Как оказалось, всё же Ходака был задержан. Его отправили домой, где он отбывал испытательный срок. Когда Ходака заканчивает школу, он сразу же возвращается в теперь наполовину затопленный Токио. Ходака идёт на встречу с Кэйсукэ, который расширил свой бизнес. Кэйсукэ подталкивает Ходаку к тому, чтобы он осмелился встретиться с Хиной. Ходака, ввиду того, что он не общался с девушкой в течение продолжительного времени, решается. Ходака идёт искать Хину. Гуляя в дождливый день, он находит её, и при этом молящейся на другом конце улицы. Ходака и Хина видят друг друга и наконец воссоединяются.
